Những hành động đầu tiên của ông với tư cách là 'nguyên thủ quốc tế' bao gồm đình chỉ hiến pháp và các hoạt động của một số tổ chức, cũng như tuyên bố lệnh giới nghiêm và đóng cửa biên giới. Mặc dù lý do của cuộc đảo chính là Amadou Toumani Touré bị cáo buộc là quản lý sai lầm của cuộc nổi dậy Tuareg, quân đội Malian đã mất quyền kiểm soát thủ đô khu vực của Kidal, Gao và Timbuktu trong vòng mười ngày kể từ chức vụ giả định của Sanogo,[11] dẫn đầu Reuters để mô tả cuộc đảo chính là "một Phản lưới nhà ngoạn mục".[12] Ngày 4 tháng 4, The New York Times báo cáo rằng ông ta đang cố gắng làm chệch hướng sự chú ý từ cuộc đảo chính sang các cuộc đấu tranh ở miền bắc, nói với một phóng viên, "Chúng ta nên quên đi một chút Ủy ban, Quốc hội, Hiến pháp - có thể chờ đợi. Chủ đề nghiêm túc, đó là miền bắc. điều quan trọng nhất."[13]

Sau các lệnh trừng phạt kinh tế và sự phong tỏa của Cộng đồng kinh tế các quốc gia Tây Phi (ECOWAS) đối với đất nước, một thỏa thuận, được môi giới tại Burkina Faso do Tổng thống Blaise Compaoré làm trung gian dưới sự bảo trợ của ECOWAS, người sẽ đảm nhận chức tổng thống trong một khả năng tạm thời cho đến khi một cuộc bầu cử có thể được tổ chức.[14]

Sau khi Tổng thống lâm thời mới Dioncounda Traoré và Thủ tướng Cheick Modibo Diarra nhậm chức, chính quyền do Sanogo lãnh đạo đã nói rõ rằng họ chỉ bước sang một bên tạm thời và chính quyền sẽ giữ vai trò giám sát cho đến cuộc bầu cử.[15][16] ECOWAS đã cho chính phủ lâm thời một năm để tổ chức bầu cử.[17]

Vào ngày 24 tháng 11 năm 2012, Sanogo đã cùng với các nhà lãnh đạo tôn giáo Malian phát biểu tại một cuộc biểu tình của Bamako chống lại chủ nghĩa cực đoan tôn giáo.[18]

Vào ngày 11 tháng 12 năm 2012, Thủ tướng Modibo Diarra đã bị chính quyền của Sanogo bắt giữ và buộc phải từ chức.[19] Động thái này, bị ECOWAS lên án, đã được tiếp nối cùng ngày bởi việc bổ nhiệm Django Sissoko làm Thủ tướng.[20]